Dans sa volonté d’améliorer la qualité de l’eau sur le bassin versant de l’Ognon, Avilley a bénéficié de la combinaison de deux projets issus du contrat de rivière Ognon et du contrat "Zone de Revitalisation Rurale" de la Communauté de communes des 2 vallées vertes. Depuis l’année dernière, ce village doubien de 160 âmes est doté d’une station de traitement, de type filtres plantés de roseaux, d’une capacité de 200 équivalents-habitants. Sa construction s’est accompagnée de la rénovation du réseau d’assainissement.
Le Crenu, affluent de l’Ognon, a fait également l’objet d’un programme de réhabilitation mené par le Syndicat mixte d’aménagement de la moyenne et basse vallée de l’Ognon sur 800 mètres au niveau de sa confluence. Les travaux ont consisté à restaurer le tracé originel de la rivière par le reméandrage de son lit, puis à effacer le seuil situé au milieu du village. Ces travaux ont été couplés à une recharge en sédiments. Le tout dans l’objectif de diversifier les habitats et de permettre une amélioration de la continuité écologique avec une augmentation de la hauteur d’eau du cours d’eau en période d’étiage.